Studio computazionale dei legami dell'estratto di foglie di olivo (OLE) alla proteina di fusione dell'HIV-1 gp41.

Bao J1, Zhang DW, Zhang JZ, Huang PL, Huang PL, Lee-Huang S.

Un recente studio sperimentale ha rilevato che OLE (estratto di foglie di olivo) ha attività anti-HIV bloccando l'ingresso del virus HIV nelle cellule ospiti [Lee-Huang, S., Zhang, L., Huang, PL, Chang, Y. e Huang, PL (2003) Attività anti-HIV dell'estratto di foglie di olivo (OLE) e modulazione dell'espressione genica della cellula ospite mediante infezione da HIV-1 e trattamento OLE. Biochimica. Biophys. Ris. Commun. 307, 1029; Lee-Huang, S., Huang, PL, Zhang, D., Lee, JW, Bao, J., Sun, Y., Chang, Y.-Tae, Zhang, JZH e Huang, PL (2007) Scoperta del piccolo -molecola di fusione dell'HIV-1 e inibitori dell'integrasi oleuropeina e idrossitirosolo. Biochimica. Biophys. Ris. Commun. 354, 872-878, 879-884]. Come parte di uno sforzo comune sperimentale e teorico, riportiamo qui uno studio computazionale per aiutare a identificare e caratterizzare i complessi di legame di diversi composti principali di OLE (estratto di foglie di olivo) alla proteina gp41 dell'involucro dell'HIV-1. Un certo numero di possibili modalità di legame si trovano agganciando l'oleuropeina ei suoi metaboliti, aglicone, acido elenolico e idrossitirosolo, alla tasca idrofobica di gp41. Le interazioni dettagliate di legame OLE-gp41 e le energie libere di legame sono ottenute attraverso la simulazione della dinamica molecolare e il calcolo MM-PBSA. Vengono identificate specifiche interazioni molecolari nei nostri complessi OLE / gp41 previsti e viene identificato l'idrossitirosolo come la principale frazione per il legame a gp41. Questo studio computazionale completa la corrispondente indagine sperimentale e aiuta a stabilire un buon punto di partenza per un ulteriore perfezionamento degli inibitori della gp41 basati su OLE.

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